Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRF8Q02556 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF8Q02556 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF8Q02556 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms