Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC3AQ02505 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC3AQ02505 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC3AQ02505 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC3AQ02505 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC3AQ02505 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MUC3AQ02505 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MUC3AQ02505 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MUC3AQ02505 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MUC3AQ02505 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MUC3AQ02505 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MUC3AQ02505 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MUC3AQ02505 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms