Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRG1Q02297 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRG1Q02297 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NRG1Q02297 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms