Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSF1Q00613 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSF1Q00613 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms