Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK17Q00537 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK17Q00537 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms