Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKOR1P84550 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKOR1P84550 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKOR1P84550 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms