Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB5BP61020 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB5BP61020 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB5BP61020 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms