Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPI1P60174 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPI1P60174 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPI1P60174 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPI1P60174 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPI1P60174 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPI1P60174 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPI1P60174 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TPI1P60174 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPI1P60174 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPI1P60174 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPI1P60174 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPI1P60174 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPI1P60174 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPI1P60174 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TPI1P60174 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPI1P60174 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPI1P60174 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPI1P60174 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPI1P60174 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPI1P60174 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPI1P60174 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPI1P60174 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPI1P60174 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPI1P60174 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPI1P60174 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPI1P60174 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPI1P60174 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPI1P60174 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPI1P60174 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPI1P60174 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPI1P60174 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPI1P60174 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPI1P60174 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPI1P60174 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TPI1P60174 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPI1P60174 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPI1P60174 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPI1P60174 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPI1P60174 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPI1P60174 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPI1P60174 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPI1P60174 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPI1P60174 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPI1P60174 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPI1P60174 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPI1P60174 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TPI1P60174 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TPI1P60174 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPI1P60174 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPI1P60174 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPI1P60174 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TPI1P60174 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPI1P60174 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPI1P60174 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPI1P60174 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPI1P60174 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPI1P60174 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPI1P60174 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPI1P60174 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPI1P60174 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPI1P60174 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPI1P60174 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPI1P60174 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPI1P60174 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPI1P60174 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPI1P60174 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TPI1P60174 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPI1P60174 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPI1P60174 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPI1P60174 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPI1P60174 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPI1P60174 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPI1P60174 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPI1P60174 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPI1P60174 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPI1P60174 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPI1P60174 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPI1P60174 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPI1P60174 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPI1P60174 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPI1P60174 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPI1P60174 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPI1P60174 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPI1P60174 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TPI1P60174 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TPI1P60174 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPI1P60174 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPI1P60174 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPI1P60174 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms