Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMP55040 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMP55040 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMP55040 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMP55040 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMP55040 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMP55040 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMP55040 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMP55040 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMP55040 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMP55040 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMP55040 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMP55040 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GEMP55040 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GEMP55040 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMP55040 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMP55040 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMP55040 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMP55040 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMP55040 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMP55040 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMP55040 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GEMP55040 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMP55040 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMP55040 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMP55040 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMP55040 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMP55040 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMP55040 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMP55040 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GEMP55040 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMP55040 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMP55040 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMP55040 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMP55040 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMP55040 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMP55040 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMP55040 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMP55040 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMP55040 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GEMP55040 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMP55040 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMP55040 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMP55040 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMP55040 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMP55040 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GEMP55040 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMP55040 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMP55040 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMP55040 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMP55040 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMP55040 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMP55040 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMP55040 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GEMP55040 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMP55040 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMP55040 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMP55040 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMP55040 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMP55040 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMP55040 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMP55040 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GEMP55040 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMP55040 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMP55040 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMP55040 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMP55040 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GEMP55040 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMP55040 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMP55040 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMP55040 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMP55040 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMP55040 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GEMP55040 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GEMP55040 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMP55040 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMP55040 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMP55040 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMP55040 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMP55040 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMP55040 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GEMP55040 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMP55040 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMP55040 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMP55040 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMP55040 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GEMP55040 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms