Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLA2G16P53816 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLA2G16P53816 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms