Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MVDP53602 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MVDP53602 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MVDP53602 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MVDP53602 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MVDP53602 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MVDP53602 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MVDP53602 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MVDP53602 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MVDP53602 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MVDP53602 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MVDP53602 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MVDP53602 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MVDP53602 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MVDP53602 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MVDP53602 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MVDP53602 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MVDP53602 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MVDP53602 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MVDP53602 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MVDP53602 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MVDP53602 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MVDP53602 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MVDP53602 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MVDP53602 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MVDP53602 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MVDP53602 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MVDP53602 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MVDP53602 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MVDP53602 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MVDP53602 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MVDP53602 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MVDP53602 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MVDP53602 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MVDP53602 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MVDP53602 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MVDP53602 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MVDP53602 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MVDP53602 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MVDP53602 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MVDP53602 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MVDP53602 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MVDP53602 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MVDP53602 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MVDP53602 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MVDP53602 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MVDP53602 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MVDP53602 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MVDP53602 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
MVDP53602 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MVDP53602 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MVDP53602 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms