Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT8P50990 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT8P50990 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT8P50990 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT8P50990 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT8P50990 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT8P50990 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCT8P50990 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT8P50990 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT8P50990 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT8P50990 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT8P50990 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCT8P50990 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT8P50990 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT8P50990 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT8P50990 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT8P50990 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCT8P50990 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCT8P50990 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCT8P50990 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCT8P50990 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCT8P50990 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCT8P50990 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8P50990 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8P50990 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8P50990 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8P50990 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8P50990 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8P50990 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCT8P50990 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCT8P50990 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCT8P50990 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8P50990 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8P50990 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8P50990 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8P50990 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCT8P50990 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8P50990 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8P50990 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8P50990 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8P50990 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8P50990 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8P50990 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8P50990 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCT8P50990 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8P50990 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8P50990 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8P50990 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8P50990 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8P50990 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8P50990 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8P50990 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCT8P50990 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8P50990 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8P50990 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8P50990 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8P50990 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8P50990 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8P50990 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8P50990 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8P50990 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCT8P50990 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8P50990 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8P50990 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8P50990 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8P50990 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCT8P50990 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms