Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPT1P50897 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPT1P50897 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPT1P50897 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPT1P50897 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPT1P50897 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPT1P50897 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPT1P50897 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPT1P50897 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPT1P50897 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPT1P50897 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPT1P50897 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPT1P50897 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPT1P50897 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPT1P50897 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PPT1P50897 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PPT1P50897 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPT1P50897 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPT1P50897 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPT1P50897 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPT1P50897 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPT1P50897 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1100.7 ms