Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLCSP50747 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLCSP50747 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLCSP50747 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLCSP50747 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLCSP50747 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLCSP50747 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLCSP50747 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLCSP50747 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HLCSP50747 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLCSP50747 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLCSP50747 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLCSP50747 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLCSP50747 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLCSP50747 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLCSP50747 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLCSP50747 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLCSP50747 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HLCSP50747 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLCSP50747 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLCSP50747 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLCSP50747 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLCSP50747 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLCSP50747 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HLCSP50747 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HLCSP50747 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLCSP50747 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLCSP50747 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLCSP50747 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLCSP50747 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLCSP50747 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLCSP50747 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLCSP50747 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLCSP50747 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLCSP50747 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms