Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VEGFBP49765 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VEGFBP49765 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VEGFBP49765 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms