Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK3P49761 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK3P49761 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK3P49761 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK3P49761 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK3P49761 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK3P49761 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK3P49761 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK3P49761 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK3P49761 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK3P49761 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK3P49761 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK3P49761 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK3P49761 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK3P49761 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK3P49761 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK3P49761 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK3P49761 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK3P49761 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK3P49761 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK3P49761 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK3P49761 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK3P49761 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK3P49761 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK3P49761 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK3P49761 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK3P49761 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK3P49761 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK3P49761 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK3P49761 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK3P49761 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK3P49761 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK3P49761 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK3P49761 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK3P49761 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK3P49761 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLK3P49761 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLK3P49761 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK3P49761 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLK3P49761 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLK3P49761 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.8 ms