Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB2P49721 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMB2P49721 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms