Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PITPNBP48739 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PITPNBP48739 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNBP48739 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms