Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEDD4P46934 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NEDD4P46934 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD4P46934 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms