Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NSFP46459 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSFP46459 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSFP46459 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSFP46459 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSFP46459 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NSFP46459 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSFP46459 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSFP46459 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSFP46459 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSFP46459 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSFP46459 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSFP46459 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSFP46459 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSFP46459 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSFP46459 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSFP46459 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSFP46459 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSFP46459 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSFP46459 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSFP46459 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSFP46459 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSFP46459 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSFP46459 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSFP46459 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSFP46459 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSFP46459 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSFP46459 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSFP46459 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSFP46459 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NSFP46459 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSFP46459 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSFP46459 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSFP46459 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSFP46459 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NSFP46459 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSFP46459 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSFP46459 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSFP46459 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSFP46459 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NSFP46459 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSFP46459 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSFP46459 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSFP46459 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSFP46459 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSFP46459 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NSFP46459 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NSFP46459 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSFP46459 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSFP46459 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSFP46459 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSFP46459 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSFP46459 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSFP46459 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSFP46459 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSFP46459 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSFP46459 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NSFP46459 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSFP46459 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSFP46459 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSFP46459 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSFP46459 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSFP46459 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSFP46459 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSFP46459 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSFP46459 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSFP46459 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NSFP46459 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSFP46459 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSFP46459 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSFP46459 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NSFP46459 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSFP46459 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSFP46459 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSFP46459 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSFP46459 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSFP46459 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSFP46459 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSFP46459 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSFP46459 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms