Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRATP43155 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRATP43155 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRATP43155 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRATP43155 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRATP43155 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRATP43155 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRATP43155 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRATP43155 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRATP43155 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRATP43155 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRATP43155 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRATP43155 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRATP43155 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRATP43155 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRATP43155 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRATP43155 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRATP43155 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRATP43155 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRATP43155 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRATP43155 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRATP43155 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRATP43155 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRATP43155 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRATP43155 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRATP43155 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRATP43155 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRATP43155 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRATP43155 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRATP43155 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRATP43155 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRATP43155 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRATP43155 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRATP43155 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRATP43155 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRATP43155 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRATP43155 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRATP43155 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRATP43155 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRATP43155 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRATP43155 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRATP43155 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRATP43155 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRATP43155 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRATP43155 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRATP43155 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRATP43155 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRATP43155 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRATP43155 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CRATP43155 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRATP43155 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRATP43155 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRATP43155 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRATP43155 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRATP43155 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms