Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASIPP42127 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASIPP42127 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASIPP42127 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASIPP42127 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASIPP42127 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASIPP42127 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASIPP42127 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASIPP42127 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASIPP42127 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASIPP42127 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASIPP42127 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASIPP42127 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ASIPP42127 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASIPP42127 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASIPP42127 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASIPP42127 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASIPP42127 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASIPP42127 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASIPP42127 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASIPP42127 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASIPP42127 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ASIPP42127 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ASIPP42127 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ASIPP42127 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ASIPP42127 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASIPP42127 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASIPP42127 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASIPP42127 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASIPP42127 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASIPP42127 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASIPP42127 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ASIPP42127 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms