Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K8P41279 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAP3K8P41279 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MAP3K8P41279 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAP3K8P41279 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MAP3K8P41279 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MAP3K8P41279 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MAP3K8P41279 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP3K8P41279 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP3K8P41279 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP3K8P41279 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP3K8P41279 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MAP3K8P41279 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K8P41279 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K8P41279 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K8P41279 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K8P41279 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K8P41279 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K8P41279 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K8P41279 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K8P41279 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K8P41279 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K8P41279 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K8P41279 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K8P41279 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K8P41279 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K8P41279 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K8P41279 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K8P41279 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K8P41279 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K8P41279 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K8P41279 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K8P41279 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K8P41279 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K8P41279 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K8P41279 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K8P41279 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms