Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGCXP38435 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGCXP38435 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGCXP38435 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGCXP38435 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGCXP38435 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGCXP38435 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGCXP38435 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGCXP38435 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGCXP38435 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGCXP38435 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGCXP38435 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGCXP38435 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGCXP38435 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGCXP38435 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GGCXP38435 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGCXP38435 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGCXP38435 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGCXP38435 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGCXP38435 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGCXP38435 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGCXP38435 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGCXP38435 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGCXP38435 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGCXP38435 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGCXP38435 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGCXP38435 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGCXP38435 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGCXP38435 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGCXP38435 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGCXP38435 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGCXP38435 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGCXP38435 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGCXP38435 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGCXP38435 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGCXP38435 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGCXP38435 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGCXP38435 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGCXP38435 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGCXP38435 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGCXP38435 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGCXP38435 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GGCXP38435 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GGCXP38435 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGCXP38435 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGCXP38435 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GGCXP38435 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGCXP38435 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGCXP38435 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGCXP38435 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GGCXP38435 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GGCXP38435 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGCXP38435 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGCXP38435 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGCXP38435 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGCXP38435 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GGCXP38435 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGCXP38435 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGCXP38435 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGCXP38435 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGCXP38435 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GGCXP38435 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GGCXP38435 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGCXP38435 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGCXP38435 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGCXP38435 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GGCXP38435 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGCXP38435 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGCXP38435 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGCXP38435 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGCXP38435 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGCXP38435 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GGCXP38435 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGCXP38435 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGCXP38435 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGCXP38435 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GGCXP38435 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGCXP38435 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGCXP38435 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGCXP38435 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms