Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHKAP35790 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHKAP35790 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKAP35790 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKAP35790 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKAP35790 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKAP35790 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKAP35790 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKAP35790 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKAP35790 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHKAP35790 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHKAP35790 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKAP35790 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKAP35790 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKAP35790 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKAP35790 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKAP35790 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKAP35790 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKAP35790 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKAP35790 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKAP35790 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHKAP35790 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHKAP35790 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHKAP35790 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKAP35790 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKAP35790 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKAP35790 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKAP35790 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKAP35790 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKAP35790 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKAP35790 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHKAP35790 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKAP35790 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKAP35790 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKAP35790 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKAP35790 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKAP35790 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKAP35790 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHKAP35790 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKAP35790 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKAP35790 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKAP35790 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKAP35790 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKAP35790 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKAP35790 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKAP35790 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKAP35790 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKAP35790 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHKAP35790 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHKAP35790 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms