Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
THBS4P35443 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
THBS4P35443 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
THBS4P35443 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
THBS4P35443 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
THBS4P35443 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
THBS4P35443 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
THBS4P35443 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
THBS4P35443 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
THBS4P35443 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
THBS4P35443 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
THBS4P35443 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
THBS4P35443 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
THBS4P35443 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
THBS4P35443 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
THBS4P35443 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
THBS4P35443 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
THBS4P35443 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
THBS4P35443 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
THBS4P35443 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
THBS4P35443 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
THBS4P35443 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
THBS4P35443 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
THBS4P35443 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
THBS4P35443 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
THBS4P35443 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THBS4P35443 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THBS4P35443 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THBS4P35443 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
THBS4P35443 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THBS4P35443 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
THBS4P35443 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
THBS4P35443 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
THBS4P35443 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THBS4P35443 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
THBS4P35443 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THBS4P35443 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THBS4P35443 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
THBS4P35443 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
THBS4P35443 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
THBS4P35443 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THBS4P35443 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THBS4P35443 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THBS4P35443 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
THBS4P35443 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THBS4P35443 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THBS4P35443 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
THBS4P35443 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THBS4P35443 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THBS4P35443 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THBS4P35443 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THBS4P35443 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
THBS4P35443 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
THBS4P35443 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THBS4P35443 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THBS4P35443 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THBS4P35443 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THBS4P35443 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THBS4P35443 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
THBS4P35443 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THBS4P35443 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
THBS4P35443 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
THBS4P35443 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
THBS4P35443 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
THBS4P35443 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
THBS4P35443 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
THBS4P35443 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms