Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BMI1P35226 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BMI1P35226 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BMI1P35226 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BMI1P35226 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BMI1P35226 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BMI1P35226 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMI1P35226 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMI1P35226 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BMI1P35226 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BMI1P35226 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BMI1P35226 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMI1P35226 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BMI1P35226 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms