Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM5P33992 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM5P33992 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM5P33992 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM5P33992 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM5P33992 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM5P33992 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM5P33992 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM5P33992 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM5P33992 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM5P33992 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM5P33992 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM5P33992 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM5P33992 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM5P33992 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCM5P33992 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM5P33992 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM5P33992 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM5P33992 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM5P33992 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM5P33992 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM5P33992 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM5P33992 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM5P33992 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM5P33992 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM5P33992 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM5P33992 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM5P33992 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM5P33992 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM5P33992 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM5P33992 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM5P33992 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM5P33992 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM5P33992 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM5P33992 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM5P33992 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MCM5P33992 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM5P33992 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MCM5P33992 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM5P33992 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM5P33992 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM5P33992 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM5P33992 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MCM5P33992 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MCM5P33992 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM5P33992 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM5P33992 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM5P33992 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM5P33992 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM5P33992 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM5P33992 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM5P33992 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM5P33992 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM5P33992 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM5P33992 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM5P33992 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM5P33992 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM5P33992 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM5P33992 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM5P33992 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM5P33992 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM5P33992 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM5P33992 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM5P33992 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM5P33992 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM5P33992 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM5P33992 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM5P33992 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM5P33992 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM5P33992 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM5P33992 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM5P33992 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM5P33992 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM5P33992 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM5P33992 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCM5P33992 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCM5P33992 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM5P33992 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM5P33992 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM5P33992 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM5P33992 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM5P33992 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM5P33992 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM5P33992 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM5P33992 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM5P33992 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MCM5P33992 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM5P33992 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCM5P33992 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms