Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTX1P32242 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX1P32242 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX1P32242 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX1P32242 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX1P32242 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX1P32242 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX1P32242 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX1P32242 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX1P32242 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX1P32242 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX1P32242 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX1P32242 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX1P32242 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX1P32242 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX1P32242 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX1P32242 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX1P32242 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX1P32242 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX1P32242 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX1P32242 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OTX1P32242 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX1P32242 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX1P32242 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX1P32242 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX1P32242 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX1P32242 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX1P32242 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX1P32242 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX1P32242 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OTX1P32242 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX1P32242 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX1P32242 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX1P32242 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX1P32242 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX1P32242 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX1P32242 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX1P32242 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OTX1P32242 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX1P32242 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX1P32242 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX1P32242 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX1P32242 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX1P32242 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX1P32242 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX1P32242 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX1P32242 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OTX1P32242 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX1P32242 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX1P32242 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX1P32242 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX1P32242 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX1P32242 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX1P32242 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX1P32242 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OTX1P32242 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX1P32242 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX1P32242 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX1P32242 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX1P32242 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX1P32242 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX1P32242 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX1P32242 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX1P32242 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX1P32242 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
OTX1P32242 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX1P32242 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX1P32242 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX1P32242 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX1P32242 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTX1P32242 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms