Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MARCKSP29966 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARCKSP29966 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARCKSP29966 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms