Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP1P29466 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP1P29466 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP1P29466 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP1P29466 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP1P29466 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP1P29466 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP1P29466 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASP1P29466 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP1P29466 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP1P29466 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP1P29466 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP1P29466 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP1P29466 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP1P29466 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASP1P29466 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP1P29466 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP1P29466 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP1P29466 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP1P29466 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP1P29466 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP1P29466 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP1P29466 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASP1P29466 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASP1P29466 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASP1P29466 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASP1P29466 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASP1P29466 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP1P29466 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP1P29466 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP1P29466 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP1P29466 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP1P29466 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASP1P29466 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP1P29466 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP1P29466 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP1P29466 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP1P29466 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP1P29466 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP1P29466 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP1P29466 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP1P29466 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP1P29466 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASP1P29466 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASP1P29466 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP1P29466 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP1P29466 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP1P29466 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP1P29466 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP1P29466 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP1P29466 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASP1P29466 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP1P29466 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP1P29466 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP1P29466 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP1P29466 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP1P29466 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP1P29466 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP1P29466 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP1P29466 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASP1P29466 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP1P29466 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP1P29466 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP1P29466 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP1P29466 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASP1P29466 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms