Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLD1P28340 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLD1P28340 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLD1P28340 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLD1P28340 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLD1P28340 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLD1P28340 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLD1P28340 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POLD1P28340 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD1P28340 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD1P28340 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD1P28340 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD1P28340 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
POLD1P28340 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLD1P28340 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLD1P28340 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POLD1P28340 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
POLD1P28340 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLD1P28340 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLD1P28340 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLD1P28340 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POLD1P28340 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLD1P28340 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POLD1P28340 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLD1P28340 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLD1P28340 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
POLD1P28340 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLD1P28340 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLD1P28340 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POLD1P28340 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLD1P28340 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLD1P28340 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLD1P28340 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLD1P28340 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLD1P28340 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
POLD1P28340 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POLD1P28340 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
POLD1P28340 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD1P28340 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD1P28340 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD1P28340 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD1P28340 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD1P28340 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD1P28340 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD1P28340 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD1P28340 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD1P28340 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POLD1P28340 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POLD1P28340 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLD1P28340 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLD1P28340 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLD1P28340 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POLD1P28340 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLD1P28340 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLD1P28340 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLD1P28340 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POLD1P28340 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLD1P28340 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLD1P28340 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLD1P28340 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLD1P28340 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
POLD1P28340 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
POLD1P28340 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLD1P28340 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POLD1P28340 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLD1P28340 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLD1P28340 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLD1P28340 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLD1P28340 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLD1P28340 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POLD1P28340 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
POLD1P28340 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD1P28340 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD1P28340 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD1P28340 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD1P28340 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD1P28340 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD1P28340 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD1P28340 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD1P28340 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POLD1P28340 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 372.2 ms