Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKCHP24723 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKCHP24723 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKCHP24723 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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