Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP100P23497 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP100P23497 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP100P23497 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP100P23497 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP100P23497 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP100P23497 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP100P23497 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SP100P23497 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP100P23497 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP100P23497 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP100P23497 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP100P23497 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SP100P23497 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP100P23497 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP100P23497 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP100P23497 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP100P23497 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SP100P23497 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP100P23497 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP100P23497 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP100P23497 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP100P23497 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP100P23497 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP100P23497 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP100P23497 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP100P23497 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP100P23497 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP100P23497 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SP100P23497 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP100P23497 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP100P23497 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SP100P23497 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SP100P23497 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SP100P23497 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SP100P23497 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SP100P23497 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP100P23497 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP100P23497 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP100P23497 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP100P23497 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP100P23497 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP100P23497 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SP100P23497 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP100P23497 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SP100P23497 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP100P23497 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP100P23497 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP100P23497 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SP100P23497 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP100P23497 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP100P23497 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP100P23497 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP100P23497 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SP100P23497 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP100P23497 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP100P23497 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP100P23497 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP100P23497 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SP100P23497 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SP100P23497 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SP100P23497 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP100P23497 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP100P23497 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP100P23497 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SP100P23497 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SP100P23497 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP100P23497 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP100P23497 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP100P23497 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP100P23497 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP100P23497 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP100P23497 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP100P23497 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SP100P23497 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP100P23497 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SP100P23497 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP100P23497 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP100P23497 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SP100P23497 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP100P23497 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP100P23497 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP100P23497 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SP100P23497 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP100P23497 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP100P23497 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SP100P23497 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms