Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYT1P21579 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT1P21579 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT1P21579 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT1P21579 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT1P21579 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYT1P21579 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT1P21579 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT1P21579 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT1P21579 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT1P21579 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT1P21579 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT1P21579 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT1P21579 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYT1P21579 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYT1P21579 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYT1P21579 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT1P21579 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYT1P21579 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT1P21579 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT1P21579 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT1P21579 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT1P21579 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYT1P21579 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT1P21579 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT1P21579 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT1P21579 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT1P21579 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT1P21579 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT1P21579 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYT1P21579 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYT1P21579 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT1P21579 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT1P21579 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT1P21579 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT1P21579 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT1P21579 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT1P21579 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT1P21579 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT1P21579 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT1P21579 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT1P21579 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT1P21579 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT1P21579 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT1P21579 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT1P21579 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT1P21579 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT1P21579 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT1P21579 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYT1P21579 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYT1P21579 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT1P21579 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT1P21579 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT1P21579 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT1P21579 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT1P21579 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT1P21579 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT1P21579 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT1P21579 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT1P21579 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT1P21579 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT1P21579 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT1P21579 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT1P21579 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT1P21579 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT1P21579 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT1P21579 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT1P21579 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT1P21579 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT1P21579 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT1P21579 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT1P21579 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT1P21579 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT1P21579 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT1P21579 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT1P21579 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT1P21579 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT1P21579 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT1P21579 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms