Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNA2P20248 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNA2P20248 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms