Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CD33P20138 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD33P20138 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD33P20138 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD33P20138 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD33P20138 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD33P20138 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD33P20138 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD33P20138 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD33P20138 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD33P20138 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD33P20138 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD33P20138 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD33P20138 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD33P20138 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD33P20138 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD33P20138 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD33P20138 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD33P20138 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD33P20138 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD33P20138 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms