Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-DPA1P20036 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms