Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDCP19113 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDCP19113 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDCP19113 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDCP19113 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDCP19113 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDCP19113 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDCP19113 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDCP19113 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDCP19113 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDCP19113 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDCP19113 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HDCP19113 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDCP19113 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDCP19113 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDCP19113 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HDCP19113 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HDCP19113 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HDCP19113 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDCP19113 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDCP19113 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDCP19113 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HDCP19113 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDCP19113 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDCP19113 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HDCP19113 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDCP19113 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDCP19113 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDCP19113 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDCP19113 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDCP19113 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDCP19113 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDCP19113 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDCP19113 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDCP19113 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDCP19113 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HDCP19113 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDCP19113 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDCP19113 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDCP19113 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDCP19113 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDCP19113 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDCP19113 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDCP19113 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDCP19113 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDCP19113 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDCP19113 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDCP19113 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDCP19113 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDCP19113 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDCP19113 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDCP19113 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDCP19113 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDCP19113 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDCP19113 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDCP19113 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms