Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT4P19013 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT4P19013 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT4P19013 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT4P19013 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT4P19013 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT4P19013 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT4P19013 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT4P19013 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT4P19013 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT4P19013 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT4P19013 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT4P19013 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT4P19013 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT4P19013 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT4P19013 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT4P19013 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT4P19013 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT4P19013 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT4P19013 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT4P19013 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT4P19013 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT4P19013 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT4P19013 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT4P19013 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT4P19013 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT4P19013 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT4P19013 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT4P19013 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT4P19013 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT4P19013 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT4P19013 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT4P19013 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT4P19013 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT4P19013 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT4P19013 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT4P19013 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT4P19013 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT4P19013 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT4P19013 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT4P19013 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT4P19013 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms