Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHCEP18577 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHCEP18577 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHCEP18577 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHCEP18577 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHCEP18577 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHCEP18577 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHCEP18577 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHCEP18577 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHCEP18577 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHCEP18577 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RHCEP18577 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHCEP18577 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RHCEP18577 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RHCEP18577 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHCEP18577 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHCEP18577 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHCEP18577 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHCEP18577 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHCEP18577 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHCEP18577 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHCEP18577 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHCEP18577 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHCEP18577 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RHCEP18577 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHCEP18577 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHCEP18577 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHCEP18577 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHCEP18577 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHCEP18577 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHCEP18577 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHCEP18577 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RHCEP18577 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RHCEP18577 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHCEP18577 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHCEP18577 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHCEP18577 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RHCEP18577 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHCEP18577 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHCEP18577 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHCEP18577 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHCEP18577 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHCEP18577 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHCEP18577 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHCEP18577 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHCEP18577 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHCEP18577 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RHCEP18577 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RHCEP18577 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHCEP18577 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHCEP18577 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHCEP18577 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHCEP18577 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHCEP18577 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHCEP18577 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHCEP18577 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHCEP18577 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RHCEP18577 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RHCEP18577 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RHCEP18577 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms