Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCP1P17987 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCP1P17987 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCP1P17987 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCP1P17987 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCP1P17987 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCP1P17987 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCP1P17987 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCP1P17987 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCP1P17987 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCP1P17987 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCP1P17987 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCP1P17987 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCP1P17987 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCP1P17987 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TCP1P17987 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCP1P17987 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCP1P17987 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCP1P17987 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCP1P17987 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCP1P17987 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCP1P17987 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCP1P17987 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCP1P17987 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TCP1P17987 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCP1P17987 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCP1P17987 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCP1P17987 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCP1P17987 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCP1P17987 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCP1P17987 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCP1P17987 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCP1P17987 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCP1P17987 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCP1P17987 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCP1P17987 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCP1P17987 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCP1P17987 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCP1P17987 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCP1P17987 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCP1P17987 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCP1P17987 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCP1P17987 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCP1P17987 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCP1P17987 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TCP1P17987 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCP1P17987 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCP1P17987 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCP1P17987 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCP1P17987 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCP1P17987 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms