Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XBP1P17861 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XBP1P17861 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XBP1P17861 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XBP1P17861 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XBP1P17861 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XBP1P17861 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XBP1P17861 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XBP1P17861 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XBP1P17861 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XBP1P17861 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XBP1P17861 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XBP1P17861 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XBP1P17861 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XBP1P17861 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XBP1P17861 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XBP1P17861 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XBP1P17861 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XBP1P17861 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XBP1P17861 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XBP1P17861 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XBP1P17861 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XBP1P17861 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
XBP1P17861 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XBP1P17861 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XBP1P17861 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XBP1P17861 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XBP1P17861 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XBP1P17861 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
XBP1P17861 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XBP1P17861 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XBP1P17861 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XBP1P17861 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XBP1P17861 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XBP1P17861 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XBP1P17861 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XBP1P17861 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XBP1P17861 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XBP1P17861 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XBP1P17861 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XBP1P17861 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XBP1P17861 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XBP1P17861 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XBP1P17861 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XBP1P17861 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XBP1P17861 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XBP1P17861 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XBP1P17861 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XBP1P17861 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
XBP1P17861 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
XBP1P17861 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XBP1P17861 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XBP1P17861 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XBP1P17861 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
XBP1P17861 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XBP1P17861 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XBP1P17861 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XBP1P17861 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XBP1P17861 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XBP1P17861 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XBP1P17861 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XBP1P17861 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XBP1P17861 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XBP1P17861 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms