Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TRIM27P14373 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM27P14373 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM27P14373 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms