Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT13P13646 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT13P13646 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT13P13646 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT13P13646 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT13P13646 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT13P13646 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT13P13646 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT13P13646 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT13P13646 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT13P13646 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT13P13646 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT13P13646 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT13P13646 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT13P13646 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT13P13646 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT13P13646 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT13P13646 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT13P13646 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT13P13646 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT13P13646 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT13P13646 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT13P13646 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT13P13646 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT13P13646 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT13P13646 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT13P13646 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT13P13646 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT13P13646 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT13P13646 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT13P13646 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT13P13646 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT13P13646 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT13P13646 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT13P13646 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT13P13646 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT13P13646 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT13P13646 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT13P13646 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT13P13646 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT13P13646 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT13P13646 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT13P13646 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT13P13646 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT13P13646 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT13P13646 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT13P13646 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT13P13646 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT13P13646 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT13P13646 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT13P13646 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT13P13646 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT13P13646 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT13P13646 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT13P13646 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT13P13646 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT13P13646 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT13P13646 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT13P13646 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT13P13646 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT13P13646 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT13P13646 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT13P13646 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT13P13646 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT13P13646 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT13P13646 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms