Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARGP13631 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RARGP13631 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RARGP13631 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARGP13631 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARGP13631 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARGP13631 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARGP13631 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARGP13631 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RARGP13631 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARGP13631 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARGP13631 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RARGP13631 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARGP13631 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARGP13631 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARGP13631 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARGP13631 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARGP13631 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARGP13631 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARGP13631 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RARGP13631 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARGP13631 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARGP13631 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARGP13631 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARGP13631 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARGP13631 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARGP13631 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARGP13631 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RARGP13631 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RARGP13631 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARGP13631 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARGP13631 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARGP13631 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARGP13631 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARGP13631 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARGP13631 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RARGP13631 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RARGP13631 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARGP13631 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RARGP13631 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARGP13631 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARGP13631 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARGP13631 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARGP13631 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RARGP13631 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RARGP13631 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARGP13631 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RARGP13631 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RARGP13631 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARGP13631 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARGP13631 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARGP13631 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARGP13631 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RARGP13631 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARGP13631 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARGP13631 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARGP13631 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RARGP13631 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARGP13631 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RARGP13631 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RARGP13631 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RARGP13631 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARGP13631 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARGP13631 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARGP13631 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARGP13631 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARGP13631 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARGP13631 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARGP13631 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARGP13631 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARGP13631 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARGP13631 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARGP13631 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARGP13631 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RARGP13631 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARGP13631 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARGP13631 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARGP13631 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARGP13631 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms