Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTN1P12814 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTN1P12814 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms