Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIP12755 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKIP12755 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKIP12755 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKIP12755 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKIP12755 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SKIP12755 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIP12755 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SKIP12755 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIP12755 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIP12755 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIP12755 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIP12755 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIP12755 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIP12755 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SKIP12755 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SKIP12755 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIP12755 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIP12755 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIP12755 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIP12755 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIP12755 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIP12755 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIP12755 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SKIP12755 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIP12755 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIP12755 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIP12755 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SKIP12755 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIP12755 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIP12755 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIP12755 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SKIP12755 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIP12755 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIP12755 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIP12755 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIP12755 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIP12755 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SKIP12755 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SKIP12755 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIP12755 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIP12755 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIP12755 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIP12755 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIP12755 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SKIP12755 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKIP12755 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKIP12755 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SKIP12755 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIP12755 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIP12755 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIP12755 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIP12755 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIP12755 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIP12755 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKIP12755 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIP12755 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIP12755 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIP12755 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKIP12755 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms