Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LAMC1P11047 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LAMC1P11047 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms