Protein–RNA interactions for Protein: P08559

PDHA1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDHA1P08559 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDHA1P08559 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PDHA1P08559 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDHA1P08559 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDHA1P08559 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDHA1P08559 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDHA1P08559 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDHA1P08559 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms